Secara Geografis Desa Melati Agung berbatasan dengan :

• Utara     : Berbatasan dengan Desa Burnai Mulya dan Desa Kota Mulya
• Selatan : Berbatasan dengan Desa Keli Rejo Kecamatan Belitang II
• Timur    : Berbatasan dengan Desa Karang Anyar dan Desa Karang Menjangan
• Barat     : Berbatasan dengan Desa Karang Melati dan Desa Kota Tanah

Jarak antara batas desa dengan ibu kota Kecamatan di Burnai Mulya kurang dari 1 Km, jarak antara desa dengan ibu kota Kabupaten di Martapura kurang dari 83 Km, jarak antara desa dengan ibu kota provinsi di Kota Palembang kurang dari 130 Km. Luas Wilayah Desa adalah ± 1.300 Ha yang terdiri dari :

• Area pemukiman penduduk = ± 52,3 Ha
• Area Perkebunan =  ± 953 Ha
• Area Persawahan= ± 275,25 Ha
• Area Perikanan = ± 5,5 Ha
• Area Peternakan = ± 2 Ha
• Area Pemakaman = ± 0,25 Ha
• Area Perkantoran = ± 2,5 Ha
• Area Prasarana Umum = 9,2 Ha

Keadaan Topografis Desa Melati Agung dilihat secara umum keadaannya merupakan daerah dataran rendah di bagian selatan sungai Macak dan  sedikit bergelombang di bagian utara sungai macak  sampai ke arah perbatasan utara, Sungai Macak sendiri merupakan sungai berukuran sedang yang mengalir dari hulu menuju hilir yakni di barat sampai ke timur dan terdapat beberapa sungai lainnya yang berukuran kecil seperti sungai Merah/Abang, sungai Puan, sungai Serdang, serta sungai lainnya yang tersebar di area perkebunan dan persawahan sehingga menjadikan kondisi tanah di desa ini sangat subur. Selain itu Desa ini juga dilalui oleh sistem irigasi teknis (sekunder dan tersier) di area persawahan di bagian selatan yang sangat mendukung aktivitas persawahan. Desa Melati Agung beriklim tropis sehingga sangat mendukung produktifitas dalam hal pertanian, perkebunan, perikanan dan peternakan karena mendapatkan pasokan sinar matahari sepanjang tahun dan curah hujan yang cukup.